More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3656 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
470 aa  959    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0489  uroporphyrinogen-III methylase  60.25 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.1 
 
 
481 aa  272  9e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  36.81 
 
 
459 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  36.81 
 
 
457 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  36.81 
 
 
457 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  36.6 
 
 
457 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  35.79 
 
 
457 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  36.38 
 
 
457 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  35.79 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  35.57 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.45 
 
 
482 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.77 
 
 
489 aa  263  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.03 
 
 
472 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  36.4 
 
 
457 aa  260  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.03 
 
 
502 aa  259  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  35.34 
 
 
458 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.45 
 
 
464 aa  256  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.92 
 
 
480 aa  256  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  36.25 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.37 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.08 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  37.37 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  37.37 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.58 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.3 
 
 
462 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  35.33 
 
 
468 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  35.71 
 
 
472 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  35.47 
 
 
464 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  33.69 
 
 
459 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.99 
 
 
493 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  36.64 
 
 
465 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.58 
 
 
473 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.26 
 
 
464 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  36.85 
 
 
465 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  34.83 
 
 
464 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  36.15 
 
 
474 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  33.33 
 
 
462 aa  246  9e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  34.17 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  34.17 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.97 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.69 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.62 
 
 
463 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.9 
 
 
479 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.35 
 
 
528 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.19 
 
 
463 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.19 
 
 
463 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.7 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  33.82 
 
 
470 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.19 
 
 
473 aa  239  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  35.05 
 
 
467 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.07 
 
 
507 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.84 
 
 
554 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  49.38 
 
 
513 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.56 
 
 
487 aa  229  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50 
 
 
503 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  51.03 
 
 
505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.06 
 
 
484 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.97 
 
 
258 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 
259 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.34 
 
 
258 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.9 
 
 
462 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.34 
 
 
258 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
258 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.04 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  46.83 
 
 
259 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.93 
 
 
258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
258 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 
510 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 
511 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
258 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
258 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
258 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.12 
 
 
258 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.13 
 
 
519 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.72 
 
 
258 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  35.68 
 
 
410 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  34.13 
 
 
476 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.83 
 
 
478 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.27 
 
 
512 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.17 
 
 
258 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.74 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.18 
 
 
513 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.81 
 
 
252 aa  213  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.27 
 
 
495 aa  212  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.52 
 
 
503 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.53 
 
 
512 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  50.85 
 
 
513 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.99 
 
 
426 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
504 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  45.68 
 
 
516 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.69 
 
 
503 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
497 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>