289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3630 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
153 aa  316  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  61.44 
 
 
153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  62.09 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  62.09 
 
 
152 aa  184  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  56.21 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  55.56 
 
 
154 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  58.82 
 
 
153 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  140  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  43.23 
 
 
156 aa  140  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  43.23 
 
 
155 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  41.67 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  41.03 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  41.03 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  40.38 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 
159 aa  124  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  40.51 
 
 
159 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.54 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.34 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  41.83 
 
 
157 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  41.45 
 
 
146 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 
159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
159 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
159 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  40.79 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  35.85 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  40.52 
 
 
153 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  39.22 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  39.74 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
167 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
167 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  38.56 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  39.38 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
160 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 
160 aa  106  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  39.87 
 
 
153 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 
156 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  39.87 
 
 
158 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  39.22 
 
 
153 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  35.95 
 
 
152 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  39.22 
 
 
153 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
160 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  37.34 
 
 
160 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  39.87 
 
 
160 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 
154 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  44.07 
 
 
160 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  37.42 
 
 
173 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
155 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  33.76 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
160 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  43.33 
 
 
150 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  55.17 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
155 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
160 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 
170 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  40.68 
 
 
160 aa  97.1  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  40.13 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  52.81 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  32.9 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  37.18 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>