More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3628 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 
645 aa  871    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  67.18 
 
 
645 aa  873    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  67.49 
 
 
641 aa  858    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  65.79 
 
 
648 aa  850    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  65.63 
 
 
648 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  100 
 
 
649 aa  1334    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  75.11 
 
 
649 aa  1021    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  54.31 
 
 
642 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  49.91 
 
 
641 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  41.69 
 
 
668 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  41.96 
 
 
690 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
667 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.54 
 
 
767 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  40.75 
 
 
672 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.27 
 
 
645 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 
643 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  44.99 
 
 
549 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  41.35 
 
 
664 aa  474  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  40.67 
 
 
630 aa  475  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.54 
 
 
709 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 
663 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  39.79 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  39.75 
 
 
685 aa  465  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
546 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  44.94 
 
 
542 aa  459  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  44.28 
 
 
581 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  43.95 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 
545 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  43.46 
 
 
540 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  44.01 
 
 
544 aa  452  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  43.83 
 
 
543 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
545 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
540 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  39.79 
 
 
651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  40.66 
 
 
656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.78 
 
 
564 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  40.1 
 
 
635 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  40.71 
 
 
544 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  42.46 
 
 
637 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  38.87 
 
 
658 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  41.4 
 
 
545 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
659 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  42.25 
 
 
543 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
662 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 
658 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
658 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
658 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.56 
 
 
638 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 
644 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
644 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
658 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 
640 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.53 
 
 
644 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  39.85 
 
 
650 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  44.09 
 
 
567 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  39.85 
 
 
653 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  42.86 
 
 
564 aa  432  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
632 aa  432  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  39.1 
 
 
650 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  38.38 
 
 
659 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  38.76 
 
 
652 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.49 
 
 
540 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  38.83 
 
 
639 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
636 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  36.18 
 
 
646 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  39.33 
 
 
541 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  36.25 
 
 
636 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  43.25 
 
 
569 aa  422  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.47 
 
 
634 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  41.22 
 
 
540 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  40.96 
 
 
540 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  39.33 
 
 
541 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
688 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  37.52 
 
 
638 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  40.67 
 
 
540 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  40.67 
 
 
540 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  38.75 
 
 
632 aa  416  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.29 
 
 
645 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  35.44 
 
 
667 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  40.67 
 
 
540 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  36.04 
 
 
643 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  38.29 
 
 
652 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  41.51 
 
 
572 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  43.65 
 
 
574 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 
536 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.43 
 
 
666 aa  412  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  40.22 
 
 
540 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  40.86 
 
 
548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 
548 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  42.59 
 
 
536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  41.51 
 
 
572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  40.3 
 
 
565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  39.3 
 
 
540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  40.18 
 
 
548 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  39.93 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.49 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  40.52 
 
 
545 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  40.04 
 
 
539 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>