45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3627 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  100 
 
 		 435 aa  868    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  50.79 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  45.12 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  37.42 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  38.34 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  35.18 
 
 		 402 aa  204  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  44.66 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  31.92 
 
 		 452 aa  146  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  30.11 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  25.17 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  26.88 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  25.4 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  32.52 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  29.05 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  30.23 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  30.23 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  28.74 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  22.77 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  26.37 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  25.85 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  26.18 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  26.18 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  25.49 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  23.75 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  24.56 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  23.74 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  24.9 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  24.33 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  27.92 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  22.07 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  21.99 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  31.08 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  31.08 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  26.59 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  28.8 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  29.79 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  24.19 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  26.51 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  26.12 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  21.23 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  27.7 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  31.88 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  32.39 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  35 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  25.52 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>