More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3625 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  100 
 
 		 596 aa  1224    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  80.73 
 
 		 598 aa  973    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  80.63 
 
 		 598 aa  969    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  59.54 
 
 		 589 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  57.83 
 
 		 591 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  51.69 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  51.24 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  51.51 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  51.24 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  51.33 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  51.24 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  51.87 
 
 		 596 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  51.24 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  50.62 
 
 		 597 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  48.74 
 
 		 593 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  47.45 
 
 		 589 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  45.56 
 
 		 588 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  47.75 
 
 		 596 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  47.92 
 
 		 583 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  47.8 
 
 		 596 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  46 
 
 		 596 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  47.29 
 
 		 596 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  42.31 
 
 		 589 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  43.99 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  50.23 
 
 		 598 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  45.6 
 
 		 597 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  44.02 
 
 		 925 aa  356  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.88 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  44.17 
 
 		 925 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  44.27 
 
 		 957 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  42.92 
 
 		 926 aa  347  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  41.7 
 
 		 464 aa  337  5e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  42.03 
 
 		 504 aa  332  9e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.28 
 
 		 608 aa  319  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.41 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  40.59 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.26 
 
 		 584 aa  276  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  38.19 
 
 		 591 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  38.05 
 
 		 609 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  37.33 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  36.59 
 
 		 586 aa  246  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 650 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  34.26 
 
 		 582 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  37.37 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  33.89 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  37.15 
 
 		 515 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  37.1 
 
 		 515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  35.91 
 
 		 561 aa  233  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.99 
 
 		 637 aa  233  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  33.48 
 
 		 582 aa  231  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.83 
 
 		 519 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  34.19 
 
 		 635 aa  226  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  33.48 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  34.98 
 
 		 616 aa  223  6e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  36.52 
 
 		 631 aa  223  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  36.34 
 
 		 603 aa  223  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  33.98 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  33.98 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  33.69 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  35.86 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  33.69 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  32 
 
 		 668 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  33.46 
 
 		 1004 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  33.19 
 
 		 519 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  33.69 
 
 		 627 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33.26 
 
 		 606 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.91 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  32.03 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  31.53 
 
 		 500 aa  203  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  31.56 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  30.77 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.15 
 
 		 478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  30.93 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  30.99 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.7 
 
 		 616 aa  199  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  32.83 
 
 		 483 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  32.71 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.36 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  29.85 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  30.15 
 
 		 517 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  30.71 
 
 		 517 aa  193  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  32.08 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  30.1 
 
 		 1005 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.54 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  31.25 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.33 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.69 
 
 		 659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.86 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.09 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 511 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.58 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  30.79 
 
 		 494 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  31.11 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  31.22 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  29.65 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  30.42 
 
 		 506 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.41 
 
 		 500 aa  163  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.28 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  32.11 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>