More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3621 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  53.16 
 
 		 840 aa  867    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  45.58 
 
 		 851 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  53.94 
 
 		 876 aa  888    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  100 
 
 		 838 aa  1706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  51.6 
 
 		 830 aa  814    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  53.23 
 
 		 843 aa  891    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  51.6 
 
 		 830 aa  814    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  59.81 
 
 		 843 aa  1001    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  35.57 
 
 		 832 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  36.34 
 
 		 846 aa  542  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  36.76 
 
 		 822 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.65 
 
 		 956 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.78 
 
 		 944 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  36.33 
 
 		 709 aa  451  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.27 
 
 		 934 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  38.24 
 
 		 659 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.16 
 
 		 927 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.56 
 
 		 921 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.11 
 
 		 957 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.55 
 
 		 960 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.88 
 
 		 930 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.31 
 
 		 952 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  33.38 
 
 		 929 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.82 
 
 		 921 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  37.85 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  36.21 
 
 		 661 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.7 
 
 		 674 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  33.01 
 
 		 646 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  34.79 
 
 		 698 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 934 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 934 aa  333  9e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.43 
 
 		 636 aa  331  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.02 
 
 		 921 aa  330  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.5 
 
 		 934 aa  328  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.65 
 
 		 934 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.68 
 
 		 934 aa  327  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.65 
 
 		 934 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.68 
 
 		 934 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.83 
 
 		 929 aa  325  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  33.2 
 
 		 757 aa  324  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.55 
 
 		 934 aa  324  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  32.53 
 
 		 751 aa  324  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.36 
 
 		 755 aa  324  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.4 
 
 		 934 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  33.46 
 
 		 755 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.4 
 
 		 934 aa  320  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  31.5 
 
 		 681 aa  320  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.12 
 
 		 909 aa  320  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.19 
 
 		 641 aa  320  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.43 
 
 		 633 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  29.29 
 
 		 667 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.91 
 
 		 647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  32.22 
 
 		 645 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  34.94 
 
 		 675 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  32.53 
 
 		 640 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  32.81 
 
 		 651 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  32.66 
 
 		 636 aa  296  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.8 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.15 
 
 		 664 aa  293  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  32.42 
 
 		 641 aa  290  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.56 
 
 		 645 aa  289  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  31.19 
 
 		 668 aa  289  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  32.76 
 
 		 629 aa  287  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  34.09 
 
 		 681 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.79 
 
 		 652 aa  280  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  31.51 
 
 		 644 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  31.81 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.56 
 
 		 712 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.96 
 
 		 652 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  32.69 
 
 		 666 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.63 
 
 		 978 aa  265  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.21 
 
 		 986 aa  266  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  31.19 
 
 		 690 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  30.85 
 
 		 685 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.38 
 
 		 714 aa  257  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  32.42 
 
 		 665 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  32.42 
 
 		 665 aa  256  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  32.42 
 
 		 665 aa  257  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  31.11 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.05 
 
 		 714 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.81 
 
 		 694 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.54 
 
 		 714 aa  254  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.52 
 
 		 714 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.69 
 
 		 703 aa  252  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.42 
 
 		 721 aa  252  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  30.85 
 
 		 714 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.05 
 
 		 714 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  32.57 
 
 		 765 aa  250  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.75 
 
 		 690 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.39 
 
 		 691 aa  249  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.54 
 
 		 690 aa  248  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.15 
 
 		 692 aa  246  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.33 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.99 
 
 		 690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.99 
 
 		 690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.41 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.99 
 
 		 690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.77 
 
 		 714 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.99 
 
 		 690 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  30.04 
 
 		 750 aa  245  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>