More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3595 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 404 aa  808    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  63.43 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  60.77 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.95 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.19 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  60.25 
 
 		 403 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  61.99 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.79 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  47 
 
 		 429 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.05 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  44.32 
 
 		 390 aa  298  8e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  43.38 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  42.07 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  38.28 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  39.25 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.12 
 
 		 430 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.5 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.84 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.07 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.65 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  38.27 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  38.61 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  38.61 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  36.57 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  37.06 
 
 		 446 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  33.48 
 
 		 449 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.19 
 
 		 466 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.03 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  39.2 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  37.8 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  40.35 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  38.89 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  37.41 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  37.06 
 
 		 437 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  34.41 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  30.97 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  31.5 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  29.67 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  30.65 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  30.65 
 
 		 372 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  30.65 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  31.63 
 
 		 408 aa  156  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 465 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  31.01 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  30.13 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  30.39 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.62 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  30.65 
 
 		 372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  27.65 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.16 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  33.01 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 		 505 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.11 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  28.02 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  32.04 
 
 		 569 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  30 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.72 
 
 		 410 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 371 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  29.58 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  29.58 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  29.58 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  29.58 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  29.58 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  29.58 
 
 		 371 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  27.62 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  29.58 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  28.13 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  31.79 
 
 		 414 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  27.51 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  29.32 
 
 		 371 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  27.23 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>