More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3590 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  81.37 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  73.53 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 102 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  70.59 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  69.61 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  60.4 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  59.22 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  55 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.46 
 
 		 223 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  57.69 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  57.28 
 
 		 103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  54.37 
 
 		 198 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  56.73 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  54.37 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>