More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3556 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 634 aa  1299    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  49.53 
 
 		 646 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  44.02 
 
 		 642 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  41.26 
 
 		 638 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  34.74 
 
 		 671 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  36.53 
 
 		 673 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  35.76 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  37.77 
 
 		 634 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 692 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  33.98 
 
 		 695 aa  336  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 641 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 690 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 659 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 655 aa  317  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 618 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 656 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 670 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 714 aa  286  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  31.48 
 
 		 671 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 634 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  30.51 
 
 		 638 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 682 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 625 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 645 aa  243  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 626 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 616 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 626 aa  224  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 628 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.87 
 
 		 631 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 624 aa  222  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.73 
 
 		 614 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.73 
 
 		 614 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 615 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 647 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.58 
 
 		 614 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.82 
 
 		 616 aa  217  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 614 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.42 
 
 		 614 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.84 
 
 		 614 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.58 
 
 		 614 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 655 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 637 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 614 aa  210  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 641 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 597 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.65 
 
 		 623 aa  208  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.6 
 
 		 615 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 632 aa  206  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 627 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  28.93 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 627 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.92 
 
 		 1023 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 611 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.79 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 627 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  28.62 
 
 		 623 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 638 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 628 aa  194  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 619 aa  194  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.9 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28.73 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 613 aa  189  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 635 aa  189  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.5 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.36 
 
 		 685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.67 
 
 		 639 aa  183  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.17 
 
 		 631 aa  183  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.2 
 
 		 685 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.85 
 
 		 645 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.2 
 
 		 821 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.88 
 
 		 685 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.88 
 
 		 685 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.88 
 
 		 685 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.88 
 
 		 685 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 737 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 627 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 624 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 612 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  29.01 
 
 		 621 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.42 
 
 		 680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 648 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 648 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 653 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 617 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  28.21 
 
 		 640 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 628 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 635 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  28.68 
 
 		 633 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 624 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  27.67 
 
 		 631 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 602 aa  165  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  27.24 
 
 		 623 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>