More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3541 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  56.81 
 
 
596 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  59.89 
 
 
598 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  55.97 
 
 
596 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  55.97 
 
 
596 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  55.97 
 
 
597 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  59.54 
 
 
596 aa  678    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  100 
 
 
589 aa  1198    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  56.47 
 
 
596 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  71.4 
 
 
591 aa  844    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  55.8 
 
 
596 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  56.64 
 
 
596 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  55.97 
 
 
596 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  60.14 
 
 
598 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  55.97 
 
 
596 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  55.31 
 
 
593 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  50.85 
 
 
596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  51.97 
 
 
596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  51.03 
 
 
596 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  51.46 
 
 
596 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  51.65 
 
 
583 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  49.15 
 
 
589 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  47.2 
 
 
588 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  46.5 
 
 
589 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  52.81 
 
 
598 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  47.3 
 
 
502 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  46.31 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  47.19 
 
 
597 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  46.74 
 
 
925 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  45.98 
 
 
925 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  45.28 
 
 
926 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  44.62 
 
 
504 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  45.24 
 
 
957 aa  363  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  45.43 
 
 
464 aa  357  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.86 
 
 
465 aa  351  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  42.35 
 
 
608 aa  343  4e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  39.18 
 
 
599 aa  299  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  40.52 
 
 
586 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  40.6 
 
 
586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  38.39 
 
 
609 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  38.34 
 
 
584 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  38.12 
 
 
582 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  39.61 
 
 
603 aa  262  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  38.37 
 
 
650 aa  260  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.5 
 
 
582 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.37 
 
 
519 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.9 
 
 
637 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  38.43 
 
 
591 aa  252  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  38.48 
 
 
605 aa  251  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  39.23 
 
 
631 aa  250  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  36.57 
 
 
582 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  36.57 
 
 
582 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  34.32 
 
 
668 aa  248  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  36.91 
 
 
616 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.8 
 
 
582 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  35.85 
 
 
606 aa  244  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  33.7 
 
 
519 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  37.24 
 
 
515 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  37.24 
 
 
515 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.99 
 
 
517 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  37.37 
 
 
515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  34.66 
 
 
561 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.9 
 
 
1004 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  34.34 
 
 
510 aa  231  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  34.66 
 
 
484 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  32.18 
 
 
627 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  32 
 
 
519 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.72 
 
 
616 aa  228  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  33.7 
 
 
635 aa  227  4e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.31 
 
 
478 aa  226  7e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  34.55 
 
 
587 aa  226  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  34.55 
 
 
587 aa  226  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.05 
 
 
517 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.9 
 
 
517 aa  223  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  34.79 
 
 
515 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.69 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.12 
 
 
483 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.13 
 
 
1005 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.5 
 
 
521 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  32.01 
 
 
659 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.44 
 
 
499 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  33.47 
 
 
512 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  31.84 
 
 
517 aa  203  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.27 
 
 
511 aa  203  7e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  31.43 
 
 
511 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.26 
 
 
482 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  29.63 
 
 
500 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.42 
 
 
577 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  31.4 
 
 
518 aa  189  9e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 
511 aa  186  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.85 
 
 
515 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.14 
 
 
460 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.72 
 
 
493 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  31.65 
 
 
576 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  32.88 
 
 
471 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  33.41 
 
 
538 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  31.26 
 
 
626 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  32.73 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.75 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.62 
 
 
509 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  31.89 
 
 
521 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>