195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3514 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 
151 aa  317  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
97 aa  102  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  55.81 
 
 
93 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  48.42 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3763  excinuclease ABC subunit C  48.89 
 
 
101 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50.56 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.25 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.73 
 
 
131 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  48.24 
 
 
93 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  48.24 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3490  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.43 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  44.19 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.32 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3525  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.59 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.506874  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.75 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.25 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4258  excinuclease ABC subunit C  42.05 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00754458  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  49.33 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  50.67 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.95 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.67 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  48.57 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  45 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  45 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  41.46 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3325  excinuclease ABC subunit C  41.38 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.369654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1970  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.712679  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.89 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.95 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.77 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.67 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.5 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  37.14 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  42.67 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0030  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.27 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.8 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  37.33 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.16 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0033  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0034  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0031  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5276  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.16 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  44.16 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.573766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0032  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0040  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.24 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  44 
 
 
338 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4129  excinuclease ABC subunit C  38.82 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21070  predicted endonuclease containing a URI domain  37.84 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0682  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000227073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  43.24 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.67 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0044  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.66 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  41.56 
 
 
298 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  40.23 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  41.56 
 
 
304 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  41.56 
 
 
334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  49.02 
 
 
264 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  41.56 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  51.11 
 
 
284 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.67 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.33 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  36.56 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.49 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  40.26 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1608  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.79 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1009  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.62 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.96 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  34.67 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0080  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.76446  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  33.68 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.06 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.49 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.25 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
90 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  34.15 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  36.9 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  46.67 
 
 
289 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  44.68 
 
 
291 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>