More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3479 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  61.32 
 
 		 269 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  57.03 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  55.82 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  52.38 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  53.2 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  49.21 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  49.21 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  44.8 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  41.15 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  41.56 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  40.74 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  41.67 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  40.74 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  41.15 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  41.56 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  42.68 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  39.92 
 
 		 312 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  42.86 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  41.15 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  41.46 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  41.46 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02065  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 317 aa  198  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  41.15 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  38.27 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  41.87 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 314 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3705  C32 tRNA thiolase  40.74 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248731  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  38.55 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  39.92 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  40.39 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  40.74 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  39.51 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  38.84 
 
 		 319 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  40 
 
 		 318 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  38.84 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  40.74 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  39.09 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  40 
 
 		 310 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1684  hypothetical protein  41.56 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2962  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828296  normal  0.0229557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  39.92 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  39.92 
 
 		 311 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  39.92 
 
 		 302 aa  191  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 310 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  38.84 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1641  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  38.27 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  40.33 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  38.84 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  39.09 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 310 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  38.75 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  38.68 
 
 		 336 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  39.76 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  37.96 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  40.33 
 
 		 289 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  39.09 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  39.09 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  38.75 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 322 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  36.78 
 
 		 322 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  36.78 
 
 		 322 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  36.78 
 
 		 322 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  37.6 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  38.84 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  38.68 
 
 		 336 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  38.68 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  39.09 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0101  C32 tRNA thiolase  39.51 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  38.68 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  38.68 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  38.68 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  38.27 
 
 		 331 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  37.34 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>