More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3456 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
307 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  68.73 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.73 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  66.56 
 
 
317 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  72.2 
 
 
322 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  66.56 
 
 
315 aa  407  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  65.8 
 
 
317 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  42.74 
 
 
850 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  39.59 
 
 
778 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.72 
 
 
298 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  41.13 
 
 
858 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.16 
 
 
236 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  41.13 
 
 
850 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  49.72 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  44 
 
 
307 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.74 
 
 
301 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  39.42 
 
 
778 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.48 
 
 
248 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  49.71 
 
 
307 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.66 
 
 
303 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.72 
 
 
679 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.48 
 
 
303 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  40.97 
 
 
850 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  40.97 
 
 
850 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  39.91 
 
 
851 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  41.41 
 
 
850 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  40.97 
 
 
850 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  39.91 
 
 
851 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.56 
 
 
230 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  45.93 
 
 
755 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  40.53 
 
 
850 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.44 
 
 
431 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
655 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.86 
 
 
814 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  37.39 
 
 
791 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  39.07 
 
 
645 aa  148  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  39.89 
 
 
655 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  38.52 
 
 
797 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  40.09 
 
 
851 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  40.09 
 
 
851 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  40.09 
 
 
851 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  38.74 
 
 
687 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.96 
 
 
704 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  38.68 
 
 
779 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  38.68 
 
 
794 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  40.78 
 
 
851 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  42.13 
 
 
817 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  39.32 
 
 
852 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  38.07 
 
 
656 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  37.1 
 
 
771 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  40.38 
 
 
852 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
637 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  40.84 
 
 
658 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  38.27 
 
 
656 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 
643 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
713 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  34.44 
 
 
759 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
713 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
713 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 
643 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
713 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  37.87 
 
 
846 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
713 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
713 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  38.37 
 
 
791 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 
805 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  37.38 
 
 
710 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.75 
 
 
705 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 
714 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 
641 aa  143  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  40.09 
 
 
766 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 
839 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.82 
 
 
643 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 
827 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  38.92 
 
 
709 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.53 
 
 
751 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
829 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.3 
 
 
712 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  36.84 
 
 
705 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  36.97 
 
 
796 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 
824 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
705 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.43 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  37.87 
 
 
844 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.6 
 
 
230 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 
844 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  37.87 
 
 
844 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  37.6 
 
 
846 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  37.87 
 
 
839 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 
793 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  39.73 
 
 
765 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  38.98 
 
 
839 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  37.72 
 
 
705 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  37.72 
 
 
705 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>