More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3441 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0412  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 
607 aa  655  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  57.38 
 
 
608 aa  701  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  59.47 
 
 
603 aa  707  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3369  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 
607 aa  638  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  58.31 
 
 
606 aa  693  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  57.64 
 
 
607 aa  704  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  57.64 
 
 
607 aa  704  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  56.64 
 
 
607 aa  682  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  58.14 
 
 
606 aa  692  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  59.23 
 
 
606 aa  756  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 
614 aa  695  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  56.64 
 
 
607 aa  682  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  56.98 
 
 
602 aa  671  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  58.04 
 
 
608 aa  711  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2993  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 
608 aa  676  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0818072  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 
608 aa  692  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.44002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  54 
 
 
607 aa  649  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  56.62 
 
 
609 aa  691  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1704  GTP-binding protein TypA  55.12 
 
 
606 aa  675  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5376e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 
608 aa  694  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
600 aa  1223  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
608 aa  684  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.86 
 
 
608 aa  707  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1215  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 
608 aa  635  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378082  normal  0.59958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  50.74 
 
 
612 aa  650  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02547  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 
609 aa  674  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.404241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  57.1 
 
 
606 aa  689  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  56.88 
 
 
608 aa  691  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  57.64 
 
 
607 aa  704  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0573  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
612 aa  645  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.179658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  57.55 
 
 
608 aa  705  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0454  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
606 aa  655  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  56.62 
 
 
609 aa  691  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  57.88 
 
 
608 aa  704  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  59.8 
 
 
603 aa  714  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  56.9 
 
 
599 aa  691  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  56.05 
 
 
614 aa  699  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 
608 aa  660  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  59.83 
 
 
609 aa  713  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  58.76 
 
 
605 aa  702  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  55.76 
 
 
606 aa  672  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  53.83 
 
 
608 aa  640  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 
615 aa  685  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  56.44 
 
 
615 aa  679  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.38787e-05  hitchhiker  1.36232e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 
613 aa  662  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 
614 aa  668  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.55128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  58.47 
 
 
606 aa  698  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  53.08 
 
 
607 aa  640  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  55.81 
 
 
608 aa  665  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 
615 aa  685  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  55.32 
 
 
608 aa  671  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 
616 aa  682  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  57.93 
 
 
602 aa  720  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  56.64 
 
 
607 aa  682  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  52.51 
 
 
607 aa  654  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 
605 aa  661  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  60.33 
 
 
609 aa  711  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  56.81 
 
 
607 aa  690  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  60.13 
 
 
607 aa  711  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  1.10369e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  56.93 
 
 
600 aa  711  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  57.64 
 
 
607 aa  704  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  57.64 
 
 
607 aa  704  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  58.67 
 
 
609 aa  707  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 
627 aa  667  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  57.14 
 
 
602 aa  672  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2798  GTP-binding protein TypA  54.29 
 
 
609 aa  643  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642081  normal  0.430779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1984  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 
615 aa  645  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  56.93 
 
 
600 aa  711  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  56.71 
 
 
602 aa  700  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 
610 aa  651  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 
608 aa  690  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  57.19 
 
 
596 aa  684  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
601 aa  660  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  58.22 
 
 
597 aa  695  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  54.03 
 
 
604 aa  652  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 
599 aa  659  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  81.83 
 
 
601 aa  1032  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  56.81 
 
 
607 aa  693  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  58.8 
 
 
607 aa  712  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  57.64 
 
 
607 aa  704  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  58.8 
 
 
607 aa  711  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  57.1 
 
 
606 aa  690  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  56.76 
 
 
613 aa  687  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2751  GTP-binding protein TypA  54.14 
 
 
611 aa  661  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  57.83 
 
 
606 aa  693  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  57.6 
 
 
602 aa  712  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  57.65 
 
 
616 aa  723  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 
603 aa  635  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 
609 aa  679  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  58.5 
 
 
608 aa  728  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  51.94 
 
 
598 aa  645  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 
595 aa  638  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 
611 aa  636  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  56.32 
 
 
595 aa  657  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  56.98 
 
 
605 aa  702  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  52.52 
 
 
604 aa  638  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  62.1 
 
 
603 aa  793  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  62.18 
 
 
604 aa  787  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  57.24 
 
 
599 aa  716  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 
608 aa  647  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>