More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3415 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  70.6 
 
 
558 aa  823    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  72.08 
 
 
558 aa  832    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  71.43 
 
 
533 aa  805    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  70.96 
 
 
558 aa  824    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
593 aa  1207    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  70.52 
 
 
558 aa  824    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  73.37 
 
 
569 aa  841    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  55.35 
 
 
561 aa  618  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  54.33 
 
 
564 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  50.09 
 
 
553 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.09 
 
 
555 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  49.27 
 
 
560 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  51.46 
 
 
554 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 
555 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  49.09 
 
 
558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  49.54 
 
 
555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  51 
 
 
554 aa  578  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  49.73 
 
 
554 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  50.27 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  48.82 
 
 
555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  48.72 
 
 
554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  48.82 
 
 
555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  48.63 
 
 
566 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  47.99 
 
 
559 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  46.92 
 
 
560 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 
549 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  46.46 
 
 
555 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  50.82 
 
 
559 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 
548 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  44.86 
 
 
618 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  48.01 
 
 
551 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  49 
 
 
556 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  46.44 
 
 
547 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  47.26 
 
 
551 aa  520  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  47.26 
 
 
551 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  47.26 
 
 
551 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  46.65 
 
 
561 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.28 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  44.3 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  44.28 
 
 
555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  44.28 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  44.28 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  44.28 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  44.28 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.1 
 
 
555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  44.46 
 
 
555 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.28 
 
 
555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  44.7 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  46.29 
 
 
557 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  47.18 
 
 
553 aa  515  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  43.56 
 
 
555 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.1 
 
 
555 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  44.52 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  44.87 
 
 
555 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  43.78 
 
 
555 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  44.02 
 
 
555 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  43.73 
 
 
583 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.75 
 
 
561 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  45.62 
 
 
550 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  49.01 
 
 
561 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  48.99 
 
 
561 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  46.44 
 
 
561 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  46.08 
 
 
553 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  45.82 
 
 
561 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.91 
 
 
557 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  45.21 
 
 
568 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  41.38 
 
 
677 aa  496  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  43.4 
 
 
662 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  43.4 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  45.34 
 
 
561 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  42.36 
 
 
557 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  42.36 
 
 
557 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.96 
 
 
555 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  42.18 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  42.81 
 
 
591 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  47.17 
 
 
561 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.36 
 
 
557 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  43.4 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.55 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.36 
 
 
557 aa  492  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  44.79 
 
 
561 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  45.24 
 
 
561 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  44.09 
 
 
554 aa  491  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  44.73 
 
 
552 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  46.25 
 
 
561 aa  492  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  41.09 
 
 
557 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  45.06 
 
 
561 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  44.48 
 
 
562 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  45.37 
 
 
565 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  44.48 
 
 
562 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  44.32 
 
 
556 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  42.31 
 
 
652 aa  488  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 
565 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>