126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3370 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  100 
 
 
275 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  88.36 
 
 
275 aa  461  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  61.82 
 
 
300 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  58.7 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  58.33 
 
 
272 aa  299  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  57.61 
 
 
272 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  57.25 
 
 
272 aa  292  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  55.8 
 
 
272 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  55.07 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.41 
 
 
289 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  44 
 
 
393 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  46.2 
 
 
375 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  45.03 
 
 
888 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  42.54 
 
 
693 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  42.54 
 
 
620 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  41.44 
 
 
692 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  44.29 
 
 
547 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  42.51 
 
 
528 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  40.88 
 
 
1562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  42.11 
 
 
892 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  40.88 
 
 
630 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  43.83 
 
 
888 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  42.01 
 
 
523 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  42.5 
 
 
753 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  43.12 
 
 
536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  41.42 
 
 
737 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  39.13 
 
 
762 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  43.72 
 
 
523 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  42.26 
 
 
514 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  39.78 
 
 
397 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  38.83 
 
 
399 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  40.21 
 
 
420 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  42.5 
 
 
537 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  41.67 
 
 
522 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  41.67 
 
 
516 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  38.66 
 
 
405 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  38.66 
 
 
405 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  38.1 
 
 
399 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  43.75 
 
 
746 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  37.82 
 
 
405 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  42.59 
 
 
735 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  40.62 
 
 
886 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  38.14 
 
 
405 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  40.45 
 
 
578 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  39.38 
 
 
432 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  38.1 
 
 
399 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  38.12 
 
 
886 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  46.92 
 
 
572 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  37.31 
 
 
405 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  37.63 
 
 
400 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  28.88 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  27.24 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.57 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  26.67 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  27.7 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  27.49 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  26.81 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  27.9 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  25.26 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  25.09 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  26.57 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  24.6 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.15 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  23.97 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  26.07 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  26.98 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  26.62 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  24.76 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  28.17 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  28.17 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  28.15 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  32.98 
 
 
395 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  25.51 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  24.13 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  25.86 
 
 
327 aa  52.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  22.38 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  32.22 
 
 
380 aa  52.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  23.02 
 
 
303 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  27.63 
 
 
281 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  24.32 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  22.26 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  31.91 
 
 
395 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  40.28 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  41.67 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  21.2 
 
 
292 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  32.22 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  23.08 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.23 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  30 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  28.57 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  26.09 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  25.62 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  21.82 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  23.18 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2561  flagellin domain protein  24.07 
 
 
285 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  22.46 
 
 
282 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  32.53 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  28.32 
 
 
320 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0113  flagellin domain protein  26.01 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.232529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1834  flagellin  21.67 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000481567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>