63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3361 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  100 
 
 
1049 aa  2179    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  50.76 
 
 
673 aa  320  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0230  hypothetical protein  32.8 
 
 
311 aa  162  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2349  hypothetical protein  37.66 
 
 
287 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  34.56 
 
 
415 aa  125  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
1162 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2349  hypothetical protein  35.35 
 
 
235 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0146741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2554  hypothetical protein  36.14 
 
 
276 aa  116  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4332  hypothetical protein  30.87 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1650  hypothetical protein  33.96 
 
 
248 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0677  hypothetical protein  39.44 
 
 
249 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5284  hypothetical protein  33.06 
 
 
263 aa  108  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246852  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4744  hypothetical protein  32.59 
 
 
263 aa  104  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5211  hypothetical protein  32.14 
 
 
263 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.398597  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  29.37 
 
 
426 aa  88.6  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  38.2 
 
 
322 aa  86.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  28.45 
 
 
587 aa  72  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5046  hypothetical protein  27.68 
 
 
224 aa  68.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  30.08 
 
 
738 aa  64.7  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  29.32 
 
 
741 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
1103 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1496  chromosome segregation ATPase-like protein  26.16 
 
 
985 aa  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0412126  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  29.06 
 
 
333 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
1087 aa  62.4  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
1288 aa  62  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  24.93 
 
 
424 aa  62  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.24 
 
 
377 aa  61.6  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  27.27 
 
 
332 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  32.5 
 
 
739 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  32.26 
 
 
395 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  23.14 
 
 
333 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  27.37 
 
 
546 aa  58.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  31.86 
 
 
394 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0395  hypothetical protein  26.58 
 
 
245 aa  55.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  unclonable  0.00000000458718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
1737 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  25.46 
 
 
317 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  25 
 
 
442 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  35.14 
 
 
591 aa  54.7  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6303  hypothetical protein  27.78 
 
 
227 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  37.37 
 
 
868 aa  54.3  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  31.76 
 
 
570 aa  53.5  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  28.32 
 
 
569 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  28.33 
 
 
384 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0636  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  52.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  20.55 
 
 
1176 aa  52  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.5 
 
 
558 aa  52  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  23.38 
 
 
331 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  23.14 
 
 
331 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.71 
 
 
331 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.71 
 
 
331 aa  50.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2901  hypothetical protein  32.17 
 
 
228 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.023795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  26.98 
 
 
525 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  25.62 
 
 
348 aa  50.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
1400 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  31.93 
 
 
435 aa  48.1  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  38.37 
 
 
369 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.52 
 
 
394 aa  47  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.45 
 
 
325 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0999  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  45.8  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  23.48 
 
 
331 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0892  hypothetical protein  23.53 
 
 
457 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.986479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  28.21 
 
 
353 aa  45.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  32.58 
 
 
638 aa  45.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>