120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3315 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.6 
 
 
212 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.7 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.02 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.75 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.09 
 
 
219 aa  98.2  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.25 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.37 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.04 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  30.54 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.84 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  30.05 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  30.05 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  30.05 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.98 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.86 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.23 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.23 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.03 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.56 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  30.16 
 
 
321 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.65 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.7 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  28 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  24.24 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  26.77 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  26.2 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.26 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.05 
 
 
339 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.34 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
331 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
331 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.5 
 
 
331 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
331 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.77 
 
 
331 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  24.61 
 
 
331 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  24.61 
 
 
331 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  24.61 
 
 
331 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  24.61 
 
 
331 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.64 
 
 
330 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  26.56 
 
 
331 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.97 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.15 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.97 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  26.06 
 
 
334 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 
335 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.96 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  26.76 
 
 
334 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  30.68 
 
 
360 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
333 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  24.21 
 
 
331 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  24.74 
 
 
331 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  29.17 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.44 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.94 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.51 
 
 
546 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  26.23 
 
 
346 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  21.83 
 
 
331 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  27.81 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
205 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.31 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.28 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.41 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  27.21 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  27.03 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.4 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  26.82 
 
 
344 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  23.6 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  25.33 
 
 
202 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.7 
 
 
207 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  22.11 
 
 
1010 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  25 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.35 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  26.9 
 
 
395 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.74 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.93 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.26 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.23 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.97 
 
 
369 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.62 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  22 
 
 
331 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  27.59 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>