262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3297 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  100 
 
 
223 aa  440  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  53.69 
 
 
220 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  44.12 
 
 
218 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  44 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  40.39 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  39.17 
 
 
221 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  43 
 
 
221 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.27 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 
225 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 
225 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 
225 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.67 
 
 
225 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  36.99 
 
 
234 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  29.2 
 
 
224 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  29.2 
 
 
224 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  32.02 
 
 
265 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 
235 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  35.18 
 
 
235 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  38.96 
 
 
229 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  29.63 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
278 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  37.93 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  28.22 
 
 
263 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  29.1 
 
 
237 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  33.66 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  31.05 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  31.05 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  32.16 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.36 
 
 
234 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  31.36 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  32 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  32.67 
 
 
221 aa  94  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  31.28 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  31.64 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  28.87 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  31.63 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  30.18 
 
 
229 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  30.56 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  31.77 
 
 
221 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  29.48 
 
 
218 aa  91.7  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  29.41 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  28.72 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  37.27 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  33.84 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  35.03 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0009  flagellar basal body rod modification protein  31.22 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  27.32 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  26.2 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  26.53 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  30.51 
 
 
226 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  31.61 
 
 
226 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  28.08 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 
294 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  27.6 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  34.9 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  29.13 
 
 
294 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  33.51 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  31.69 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  34.25 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  30.06 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  32.39 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  26.29 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  28 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  27.4 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  31.98 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  29.57 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  31.98 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  28.99 
 
 
287 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  34.46 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  33.1 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  29.34 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  29.34 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  34.84 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  34.84 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  29.67 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  31.05 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02926  flagellar basal body rod modification protein  31.08 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  30.67 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  30.05 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  31.1 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  31.94 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  30.48 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  29.02 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  32.65 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  31.33 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  27.51 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  30.34 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>