15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3291 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3291  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  285  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  47.83 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3439  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  46.4 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3098  hypothetical protein  42.19 
 
 
158 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3825  putative flagellar biogenesis protein  48.8 
 
 
159 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  37.63 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  24.41 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.49 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  25.66 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  34.67 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.05 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  32.1 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  39.39 
 
 
144 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  31.82 
 
 
140 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>