More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3284 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
309 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.6 
 
 
308 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  65.57 
 
 
309 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.89 
 
 
311 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.88 
 
 
310 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  50.33 
 
 
304 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.42 
 
 
301 aa  265  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.43 
 
 
306 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  43.14 
 
 
289 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  43.14 
 
 
289 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.69 
 
 
306 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  45.98 
 
 
271 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.06 
 
 
333 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.36 
 
 
271 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.97 
 
 
293 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.34 
 
 
299 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.77 
 
 
276 aa  229  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.59 
 
 
270 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.62 
 
 
297 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.88 
 
 
308 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.37 
 
 
343 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  45.59 
 
 
270 aa  221  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.59 
 
 
296 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  43.19 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.92 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.92 
 
 
296 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.51 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  44.98 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  44.49 
 
 
279 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  44.98 
 
 
295 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  44.61 
 
 
296 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.76 
 
 
293 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.67 
 
 
301 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.28 
 
 
293 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.77 
 
 
276 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.98 
 
 
271 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  41.64 
 
 
288 aa  208  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.75 
 
 
288 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.11 
 
 
270 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.87 
 
 
290 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.05 
 
 
303 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.86 
 
 
288 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
293 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
293 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
293 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  41.09 
 
 
280 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.82 
 
 
277 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  41.09 
 
 
280 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.28 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.94 
 
 
293 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.48 
 
 
277 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  42.51 
 
 
280 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.85 
 
 
277 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.88 
 
 
293 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  41.48 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  43.07 
 
 
283 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  41.85 
 
 
274 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.85 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.48 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.95 
 
 
276 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  38.93 
 
 
300 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.02 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.91 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  34.24 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.99 
 
 
293 aa  195  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.7 
 
 
274 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.19 
 
 
370 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  37.74 
 
 
280 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.26 
 
 
290 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.62 
 
 
281 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  35.71 
 
 
295 aa  189  4e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.19 
 
 
295 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.01 
 
 
298 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.76 
 
 
268 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.6 
 
 
519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.37 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.74 
 
 
273 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  42.05 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  42.05 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.73 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.6 
 
 
283 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.75 
 
 
270 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.69 
 
 
275 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
295 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  37.24 
 
 
272 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 
295 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  36.49 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 
291 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0060  ParaA family ATPase  35.92 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0101  ParaA family ATPase  35.92 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  39.84 
 
 
266 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  37.39 
 
 
272 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.83 
 
 
288 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000540188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>