More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3251 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  79.72 
 
 		 433 aa  719    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 430 aa  877    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  74.36 
 
 		 432 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  78.79 
 
 		 430 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  75.06 
 
 		 432 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  77.62 
 
 		 431 aa  704    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  75.29 
 
 		 430 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  65.03 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  60.84 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  59.44 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  59.44 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  59.44 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.01 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.58 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.84 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 427 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 		 446 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  55.9 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  53.1 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  55.76 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  55.97 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 		 431 aa  471  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  51.63 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  53.83 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  54.93 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  53.95 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 430 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  54.93 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  52.64 
 
 		 446 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 444 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 442 aa  461  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  51.72 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  53.05 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  51.72 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  53.4 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.18 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  52.82 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  53.97 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  458  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  53.1 
 
 		 438 aa  458  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  53.69 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  51.26 
 
 		 448 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  0.00000299679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  52.87 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  52.07 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  51.49 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  56.55 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>