More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3237 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3237  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  829    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1640  major facilitator transporter  77.23 
 
 		 412 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000762127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2478  major facilitator superfamily MFS_1  75.85 
 
 		 415 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.496418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1741  major facilitator superfamily MFS_1  76.81 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0514  major facilitator transporter  70.8 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0627  major facilitator superfamily MFS_1  70.07 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000123626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0429  major facilitator superfamily MFS_1  69.59 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0150  hypothetical protein  67.4 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00771241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2840  major facilitator superfamily MFS_1  56.73 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2161  major facilitator superfamily MFS_1  54.43 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  0.722113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4757  major facilitator superfamily MFS_1  55.45 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0254907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0221  major facilitator transporter  59.62 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1654  major facilitator superfamily MFS_1  55.77 
 
 		 412 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4712  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0219  major facilitator superfamily MFS_1  59.13 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0206  major facilitator superfamily transporter  59.13 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0230  major facilitator superfamily MFS_1  58.87 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2949  major facilitator superfamily MFS_1  55.75 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3632  major facilitator superfamily MFS_1  54.74 
 
 		 422 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.361546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2725  major facilitator superfamily permease  53.17 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3636  major facilitator superfamily MFS_1  54.11 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.138317  normal  0.90769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  25.15 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  31.65 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  31.36 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  25.76 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.26 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  24.66 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  29.63 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  29.63 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  27.98 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  29.63 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  25.66 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  27.37 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  27.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.78 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.37 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>