228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3198 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  316  8e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  91.3 
 
 
161 aa  292  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 
161 aa  271  2e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  80.75 
 
 
161 aa  266  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  78.88 
 
 
161 aa  258  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  78.75 
 
 
161 aa  251  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  78.75 
 
 
161 aa  249  9e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  70 
 
 
161 aa  218  2e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  194  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  58.86 
 
 
164 aa  194  4e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  61.01 
 
 
163 aa  189  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  59.12 
 
 
166 aa  188  3e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
164 aa  184  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  57.59 
 
 
165 aa  183  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  1e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  58.86 
 
 
163 aa  182  2e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  182  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  59.49 
 
 
163 aa  181  4e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  60.13 
 
 
163 aa  180  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  55.06 
 
 
163 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  53.8 
 
 
163 aa  173  1e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.20146e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  49.69 
 
 
161 aa  172  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  49.69 
 
 
161 aa  172  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 
163 aa  170  8e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  50.62 
 
 
164 aa  163  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
163 aa  160  8e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
162 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
162 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  51.25 
 
 
162 aa  154  5e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
162 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
163 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
162 aa  151  3e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
162 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  150  6e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  51.88 
 
 
162 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
160 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
160 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  47.2 
 
 
161 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  46.58 
 
 
161 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  146  1e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  146  1e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  48.75 
 
 
164 aa  145  2e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
172 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
159 aa  143  8e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
159 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  47.5 
 
 
165 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  44.94 
 
 
163 aa  141  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
160 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  48.45 
 
 
163 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  49.07 
 
 
165 aa  141  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.72661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
164 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
165 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  140  1e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
163 aa  140  1e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  140  1e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
163 aa  140  1e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  48.15 
 
 
163 aa  139  1e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  139  1e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  139  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  139  2e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  139  2e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  139  2e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 
163 aa  139  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  3.04548e-06 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
164 aa  139  2e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  48.77 
 
 
167 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  46.84 
 
 
163 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>