116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3179 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  51.65 
 
 		 196 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  51.1 
 
 		 1128 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  51.65 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  48.95 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  46.99 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  47.87 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  45.3 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  46.89 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  41.57 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  45.25 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  44.26 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  39.01 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  39.56 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  38.46 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  39.01 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  39.01 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  38.67 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  39.56 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  36.26 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  35.59 
 
 		 188 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  35.16 
 
 		 188 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  45.6 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  37.16 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  42.22 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  48.59 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  36.07 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  32.86 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  36.54 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  49.23 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  33.86 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  36.81 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  36.81 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  38.46 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  40.36 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  32.77 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  32.77 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  31.32 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  37.43 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  30 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  39.05 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  29.85 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.31 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  28.57 
 
 		 475 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  34.09 
 
 		 314 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.88 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  29.47 
 
 		 693 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.36 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  32.52 
 
 		 355 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  30.87 
 
 		 420 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.8 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2627  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  39.44 
 
 		 433 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  39.62 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 350 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.92 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  36.51 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.78 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  32.63 
 
 		 390 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.35 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.35 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  38.98 
 
 		 351 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  50 
 
 		 430 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 369 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.47 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  28.97 
 
 		 465 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  28.97 
 
 		 465 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.72 
 
 		 256 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  26.62 
 
 		 271 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  41.18 
 
 		 242 aa  42  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 		 256 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 278 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.72 
 
 		 256 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 276 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2305  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 341 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.94 
 
 		 425 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.48 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>