More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3112 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  100 
 
 		 412 aa  850    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  63.13 
 
 		 419 aa  544  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  55.45 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  55.61 
 
 		 421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  55.8 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  54.17 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  53.85 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  55.61 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  51.22 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  52.63 
 
 		 400 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  50.74 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  51.73 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  50.74 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  49.88 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  50 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  48.89 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  47.54 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  51.26 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  47.76 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  47.78 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  45.57 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  46.31 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  45.65 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  45.7 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  44.39 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  45.48 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  45.25 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  44.08 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  44.76 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  45.18 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  45.97 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  43.13 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  43.51 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  43.89 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  45.61 
 
 		 403 aa  328  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  43.83 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  42.64 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  40.25 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  40.99 
 
 		 404 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  41.98 
 
 		 404 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  41.98 
 
 		 404 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  42.22 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  41.73 
 
 		 391 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  41.16 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  42.3 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  44.27 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  40.51 
 
 		 404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  40.51 
 
 		 404 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  40.51 
 
 		 404 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  40.15 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  41.4 
 
 		 404 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  41.41 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  41.92 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  41.02 
 
 		 402 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  41.81 
 
 		 415 aa  302  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  37.89 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  42.78 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  41.34 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  39.95 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  40.46 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  40.3 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  37.68 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  37.68 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  40.73 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  40.1 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  40.1 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  40.62 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  40.31 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  40.99 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  38.39 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  41.73 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  41.1 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  37.88 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  41.65 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.98 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  40.98 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.98 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  40.53 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.31 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 397 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  39.59 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  38.31 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  37.89 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  39.69 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  38.72 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  38.14 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  38.69 
 
 		 403 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  39.66 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  38.94 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  37.47 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  39.66 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  39.26 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  40.19 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  40.33 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.5 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  37.78 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  35.99 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.27 
 
 		 422 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  37.28 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  39.02 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>