68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3109 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 148 aa  290  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  69.39 
 
 		 147 aa  215  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  166  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  52.38 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  53.74 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  54.42 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  53.74 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  45.89 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  43.54 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  42.76 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  46.58 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  41.5 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  42.66 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  42.07 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  43.24 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  43.24 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  39.46 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  42.67 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  31.47 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  34.91 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  26.9 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.9 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.9 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  28.97 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.39 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  29.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  29.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.97 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  24.66 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  24.32 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.9 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  40.74 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  26.06 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  30.09 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  29.66 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  28.69 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  29.17 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  23.97 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  22.38 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  25.68 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  32.65 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  30.07 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  30.07 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  26.85 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  30.2 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  24.44 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  27.97 
 
 		 143 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  26 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  29.52 
 
 		 155 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  29.52 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  25.85 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  26.9 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  26.9 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>