More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3107 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
355 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  58.33 
 
 
329 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  53.07 
 
 
335 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  54.46 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  53.4 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  53.4 
 
 
333 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  52.03 
 
 
328 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  50.84 
 
 
335 aa  268  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  41.98 
 
 
335 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  38.46 
 
 
339 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  35.11 
 
 
328 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  35.11 
 
 
328 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  38.15 
 
 
345 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 
345 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  33.82 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  41.28 
 
 
330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  39.73 
 
 
332 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  36.33 
 
 
344 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  34.03 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  34.07 
 
 
326 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 
368 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  33.92 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  39.86 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  34.6 
 
 
331 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  35.27 
 
 
331 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  39.73 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  33.86 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  34.42 
 
 
348 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  33.68 
 
 
334 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  32.68 
 
 
328 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 
340 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  35.05 
 
 
331 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  34.03 
 
 
359 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  37.84 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  29.52 
 
 
349 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  35.05 
 
 
331 aa  156  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  35.05 
 
 
332 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 
336 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  35.05 
 
 
332 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  35.05 
 
 
331 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  35.05 
 
 
331 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  35.05 
 
 
331 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  35.05 
 
 
331 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  35.05 
 
 
331 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 
350 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  35.43 
 
 
334 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  36.46 
 
 
342 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  34.35 
 
 
477 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  35.62 
 
 
343 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  38.06 
 
 
347 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  36.42 
 
 
339 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  31 
 
 
281 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  31 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  36.61 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  28.44 
 
 
327 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  35.84 
 
 
337 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  38.28 
 
 
346 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 
354 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  34.81 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  35.41 
 
 
357 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  33.78 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  36.82 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  30.55 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  35.49 
 
 
345 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  31.27 
 
 
304 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  34.58 
 
 
355 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
363 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.68 
 
 
372 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 
355 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  32.13 
 
 
355 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  30.33 
 
 
310 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  34.58 
 
 
355 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  34.58 
 
 
355 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 
353 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  35.65 
 
 
355 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 
357 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  38.43 
 
 
357 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  34.94 
 
 
355 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 
357 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 
355 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  31.23 
 
 
302 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  35.45 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  31.66 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.99 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  34.89 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  32.79 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  32.13 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
341 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  23.69 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>