More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3067 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.58 
 
 		 592 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  100 
 
 		 621 aa  1240    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  60.39 
 
 		 602 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  55.03 
 
 		 603 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  55.03 
 
 		 602 aa  666    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  59.58 
 
 		 625 aa  733    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  58.09 
 
 		 616 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 594 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  40.88 
 
 		 635 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 		 622 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  42.44 
 
 		 592 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  40.22 
 
 		 607 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 642 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 600 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  37.16 
 
 		 611 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  37.91 
 
 		 614 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  43.66 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  37.87 
 
 		 611 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  36.25 
 
 		 600 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  38.44 
 
 		 608 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.78 
 
 		 591 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 586 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  36.69 
 
 		 613 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.03 
 
 		 611 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  35.57 
 
 		 589 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.78 
 
 		 610 aa  422  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  37.44 
 
 		 619 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.68 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.62 
 
 		 590 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  41.57 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  40.23 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  36.2 
 
 		 603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.04 
 
 		 597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  35.52 
 
 		 588 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  40 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  37.76 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.45 
 
 		 617 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.84 
 
 		 614 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  40.23 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  35.44 
 
 		 588 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.1 
 
 		 588 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  39.34 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  40.23 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  38.1 
 
 		 602 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  35.53 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.94 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.52 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.67 
 
 		 597 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.26 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.67 
 
 		 597 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.53 
 
 		 594 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  38.25 
 
 		 626 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.26 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.98 
 
 		 632 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.69 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.01 
 
 		 584 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  35.88 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  36.88 
 
 		 626 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.66 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  32.72 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  37.23 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  38.4 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.46 
 
 		 622 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  34.65 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  34.87 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.28 
 
 		 594 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.16 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  36.21 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  37.91 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  35.73 
 
 		 645 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.39 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  32.55 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  35.97 
 
 		 585 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 636 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.22 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.32 
 
 		 579 aa  365  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.48 
 
 		 620 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.6 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.6 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 587 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.44 
 
 		 581 aa  360  4e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.75 
 
 		 610 aa  359  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  34.32 
 
 		 606 aa  359  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 600 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  39.24 
 
 		 599 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2332  ABC transporter ATP-binding and permease protein  36.17 
 
 		 593 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.11 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  31.87 
 
 		 582 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  33 
 
 		 576 aa  354  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.61 
 
 		 577 aa  353  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.49 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  32.69 
 
 		 631 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>