111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3000 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 370 aa  753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  54.9 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  53.65 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  53.54 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  53.93 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  50.14 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  29.96 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.67 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  32.41 
 
 		 631 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 779 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  28 
 
 		 414 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  25.28 
 
 		 779 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.57 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  28.46 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.05 
 
 		 780 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  30.08 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  24.9 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  27.68 
 
 		 653 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.72 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  29.14 
 
 		 704 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  30.15 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.56 
 
 		 865 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1676 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.41 
 
 		 875 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.79 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 237 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 		 237 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  38.38 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.53 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.91 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.41 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.54 
 
 		 253 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.42 
 
 		 232 aa  46.2  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.19 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.07 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 		 240 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  24.03 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.37 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 202 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.86 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  28 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  26.5 
 
 		 199 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.1 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.58 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.23 
 
 		 240 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.36 
 
 		 229 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.1 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  26.64 
 
 		 564 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.74 
 
 		 237 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.05 
 
 		 242 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5368  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 263 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  26.03 
 
 		 518 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>