78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2970 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
175 aa  340  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  72.25 
 
 
174 aa  262  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  70.29 
 
 
175 aa  257  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  70.29 
 
 
175 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  67.43 
 
 
175 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.6 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  65.12 
 
 
173 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  46.29 
 
 
185 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.91 
 
 
197 aa  134  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  45.66 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  43.21 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.21 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  40.48 
 
 
186 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  40.4 
 
 
192 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  35.39 
 
 
419 aa  99  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  39.31 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.5 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  38.62 
 
 
237 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
647 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.58 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  33.54 
 
 
373 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  34.21 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  39.37 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.19 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  29.19 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  28.65 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  28.23 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.06 
 
 
218 aa  61.6  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  31.32 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.96 
 
 
352 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.77 
 
 
354 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  33.12 
 
 
344 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  32.54 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.2 
 
 
140 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.23 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.23 
 
 
149 aa  51.2  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  27.22 
 
 
371 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.58 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.33 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  29.29 
 
 
140 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  27.73 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.47 
 
 
344 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.78 
 
 
151 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.06 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.48 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.5 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.35 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.43 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.71 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.65 
 
 
330 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.56 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.97 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0335  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5569  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0380348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  36 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.13 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.95 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2496  integral membrane protein  40.48 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.37 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.35 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.07 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  27.87 
 
 
361 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  43.08 
 
 
159 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  32.94 
 
 
159 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.74 
 
 
332 aa  41.6  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  25.42 
 
 
136 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.86 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.63 
 
 
345 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.22 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  44.23 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.33 
 
 
371 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  28.33 
 
 
354 aa  41.2  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.67 
 
 
157 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 
290 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>