More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2954 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1127 aa  2289    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1195 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1229 aa  433  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.24 
 
 		 1560 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1287 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 944 aa  376  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 1110 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  37.03 
 
 		 1028 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1452 aa  369  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.9 
 
 		 982 aa  362  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1363 aa  362  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 932 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  46.7 
 
 		 661 aa  353  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 945 aa  350  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 		 860 aa  349  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 1066 aa  349  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  47 
 
 		 666 aa  347  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1407 aa  347  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.45 
 
 		 853 aa  346  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  34.17 
 
 		 955 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 916 aa  344  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 1313 aa  344  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 902 aa  342  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 738 aa  341  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.95 
 
 		 1060 aa  337  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 865 aa  337  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 982 aa  337  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 817 aa  337  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 765 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 781 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 717 aa  336  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.49 
 
 		 772 aa  335  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.19 
 
 		 1135 aa  334  7.000000000000001e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 882 aa  333  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 		 873 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.18 
 
 		 968 aa  333  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 		 793 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1433 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 718 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 789 aa  328  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 1199 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  37.78 
 
 		 794 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  39.09 
 
 		 732 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 957 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  34.24 
 
 		 1026 aa  327  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 724 aa  327  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  43.66 
 
 		 736 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.62 
 
 		 655 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.7 
 
 		 1023 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1284 aa  325  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  44.16 
 
 		 578 aa  325  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 		 1245 aa  324  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 764 aa  323  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.38 
 
 		 763 aa  323  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1007 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 827 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  44.44 
 
 		 735 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 767 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.28 
 
 		 606 aa  322  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1222 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1177 aa  322  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1064 aa  321  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 1128 aa  321  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 		 1135 aa  319  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 846 aa  319  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 743 aa  319  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 940 aa  319  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1267 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  38.52 
 
 		 787 aa  318  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.19 
 
 		 582 aa  318  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1068 aa  317  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  37.19 
 
 		 559 aa  317  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  41.35 
 
 		 803 aa  317  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  42.59 
 
 		 588 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 863 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1768 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.13 
 
 		 631 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  33.57 
 
 		 853 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 604 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  43.14 
 
 		 1193 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1078 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 790 aa  314  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 704 aa  313  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.88 
 
 		 620 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  38.55 
 
 		 571 aa  313  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 965 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 896 aa  313  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 785 aa  313  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 827 aa  312  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.89 
 
 		 2035 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  42.49 
 
 		 589 aa  311  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 963 aa  311  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 		 898 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.93 
 
 		 2213 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1767 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 1226 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.5 
 
 		 1582 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1767 aa  308  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  40.96 
 
 		 544 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1548 aa  308  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>