69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2944 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  43.29 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  38.16 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  33.64 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  27.46 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  27.46 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  27.6 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  26.2 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  26.2 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  25.88 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  28.65 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  24.86 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  24.59 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  27.18 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  23.83 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  26.56 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  26.15 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  31.43 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  24.75 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  27.39 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 631 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0053  hypothetical protein  25.79 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2859  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.582103  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1459  cytidine deaminase  24.7 
 
 		 396 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.58 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  28.02 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  28.05 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  19.35 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  22.79 
 
 		 1301 aa  45.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2542  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.05 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  27.64 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2496  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.05 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2584  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.05 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2596  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.05 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  23.85 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  25.67 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.36 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2705  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.05 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.48 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  25.67 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  25.67 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  27.64 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  24.42 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  24.27 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  26.11 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.81 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  26.11 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  25.56 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  24.52 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  24.31 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  22.3 
 
 		 575 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  22.03 
 
 		 578 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 295 aa  42  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>