90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2901 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  49.46 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.09 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  46.42 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.44 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  41.61 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  44.11 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  42.01 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  41.2 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  37.12 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  39.65 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  35.36 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  26.72 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  30.19 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  27.9 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  26.47 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  27.23 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  26.81 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  25.73 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  25.73 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  25.73 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  25.32 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.9 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.24 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  23.66 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  24.9 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  23.43 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.9 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.9 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.9 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.9 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  26.13 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.73 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  25.93 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  22.54 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  22.76 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  22.87 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  24.07 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  24.89 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  25.31 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  23.01 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  22.71 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  25.51 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.48 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  23.74 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  23.74 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  22.22 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.73 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  24.04 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  22.41 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  25.83 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.99 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.43 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  23.86 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  22.93 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  26.79 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  23.47 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  23.85 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  24.69 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  25.26 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  22.22 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  22.78 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  25.99 
 
 		 384 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  22.63 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  24.67 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  26.16 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.7 
 
 		 584 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  21.65 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  22.27 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  22.61 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  24.81 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.71 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  21.08 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.47 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.55 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2753  hypothetical protein  26.25 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.249359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.41 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  24.17 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  27.73 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.48 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  21.92 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.59 
 
 		 321 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  23.18 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  26.23 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  22.52 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>