More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2884 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2884  Patatin  100 
 
 		 315 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  69.77 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  67.77 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  54.78 
 
 		 335 aa  318  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  40.71 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  45.55 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  44.29 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  42.05 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  42.52 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  41.03 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  43.45 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  41.25 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  44.34 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  43.69 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  39.34 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  41.58 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  42.86 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  41.44 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  41.44 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  42.43 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  42.36 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  39.61 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  41.1 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  35.92 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  35.92 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  35.92 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  35.92 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  39.51 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  39.63 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  39.6 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  36.57 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  36.28 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  35.6 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  38.14 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  35.95 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  38.46 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  36.05 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  37.12 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  36.36 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  36.91 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  36.91 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  36.91 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  41.1 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  36.91 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  36.91 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  38.12 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  37.19 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  42.32 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  41.01 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  38.27 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  39.8 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  37.3 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  37.85 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  42.41 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  41.08 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  38.31 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  38.31 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  38.28 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  37.43 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  40.37 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  40.45 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  38.93 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  38.83 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  37.25 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  37.5 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  36.42 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  37.27 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  37.79 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  38.36 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  41.05 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  39.86 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  35.61 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  38.18 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  40 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  37.16 
 
 		 263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  39.06 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  40.14 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  40 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  40.7 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  39.62 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  39.62 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  39.62 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  39.62 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  39.31 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  39.2 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  37.93 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  37.28 
 
 		 263 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  38.33 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  38.33 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  37.28 
 
 		 263 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  38.33 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  38.33 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  37.98 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  37.21 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  36.33 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  36.19 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.83 
 
 		 728 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  40.83 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>