218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2822 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  100 
 
 
393 aa  800  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  55.73 
 
 
393 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  54.72 
 
 
376 aa  417  1e-115  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  54.18 
 
 
376 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  53.62 
 
 
375 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.18402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  51.41 
 
 
389 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  51.16 
 
 
391 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  44.05 
 
 
375 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.03 
 
 
738 aa  309  6e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.38 
 
 
713 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  40 
 
 
375 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  40 
 
 
375 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  41.35 
 
 
374 aa  295  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  41.55 
 
 
399 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  40.59 
 
 
387 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  40 
 
 
385 aa  286  3e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  42.43 
 
 
374 aa  284  2e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  41.02 
 
 
380 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  40.53 
 
 
381 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  40.21 
 
 
388 aa  276  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  39.84 
 
 
380 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  40 
 
 
374 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  38.67 
 
 
374 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  40.31 
 
 
387 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  42.25 
 
 
380 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  38.03 
 
 
484 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.74 
 
 
711 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  37.87 
 
 
374 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  40.31 
 
 
387 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.22 
 
 
705 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  38.65 
 
 
387 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  39.79 
 
 
387 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  37.53 
 
 
374 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  42.41 
 
 
382 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.95 
 
 
712 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  39.84 
 
 
376 aa  254  1e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.89 
 
 
705 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  38.04 
 
 
398 aa  252  7e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.64 
 
 
712 aa  252  9e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.19 
 
 
711 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.77 
 
 
708 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.71 
 
 
713 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.71 
 
 
713 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.71 
 
 
713 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 
702 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.63679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 
702 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 
702 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 
702 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.26 
 
 
702 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.79 
 
 
707 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.92 
 
 
712 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.58 
 
 
738 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.77 
 
 
749 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  33.7 
 
 
392 aa  246  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.09 
 
 
711 aa  244  1e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.46 
 
 
702 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.72198e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.46 
 
 
702 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.46 
 
 
702 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.66949e-05  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.46 
 
 
702 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.81203e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.73 
 
 
702 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.6 
 
 
721 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  38.46 
 
 
702 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  38.46 
 
 
702 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  38.46 
 
 
702 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  36.41 
 
 
432 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.52 
 
 
706 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.66 
 
 
709 aa  242  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.08 
 
 
730 aa  242  8e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.68261e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.24 
 
 
725 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.13 
 
 
709 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.52 
 
 
702 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.19 
 
 
711 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.2 
 
 
702 aa  240  3e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.08 
 
 
730 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.81 
 
 
730 aa  239  6e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.81 
 
 
730 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.86 
 
 
709 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  38.72 
 
 
395 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.06959e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  35.92 
 
 
432 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.46 
 
 
705 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.6 
 
 
709 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.68014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.71 
 
 
711 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.6 
 
 
709 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  34.98 
 
 
430 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.24 
 
 
725 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  1.88031e-11 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.2 
 
 
706 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.2 
 
 
706 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  36.91 
 
 
395 aa  235  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.2 
 
 
706 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  34 
 
 
426 aa  234  2e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.99 
 
 
756 aa  234  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  33.06 
 
 
377 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  37.67 
 
 
762 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.14 
 
 
718 aa  233  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  35.73 
 
 
393 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.9 
 
 
707 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  34.32 
 
 
413 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  35.64 
 
 
706 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.27 
 
 
718 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  32.35 
 
 
374 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>