178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2799 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  42.8 
 
 		 244 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  45.04 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  42.98 
 
 		 244 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  44.63 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  41.78 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  41.78 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  38.85 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  31.45 
 
 		 258 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  36.57 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  36.24 
 
 		 253 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  33.56 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  32.89 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  36.08 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  31.48 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.92 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  35.26 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  31.96 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  26.8 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  28.41 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  35.39 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  35.39 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  35.39 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  25.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  32.47 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  35.37 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  32.05 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  29.45 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  32.94 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  25.88 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  31.61 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  32.93 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  31.61 
 
 		 300 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  27.86 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  30.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2462  DNA repair protein RecO  34.29 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.48 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  36.36 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  31.33 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  32.02 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  32.56 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  34.46 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  48.33 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  29.22 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  41.89 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  27.92 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  46.43 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0186  DNA repair protein RecO  25.12 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.93882 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  30.49 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  32.56 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  23.65 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  32.08 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  26.35 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  31.41 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  31.93 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  35.71 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  45.45 
 
 		 284 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  30.99 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  46.81 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  40.98 
 
 		 265 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  44.64 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>