More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2710 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  100 
 
 
239 aa  483  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  87.18 
 
 
239 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  85.9 
 
 
239 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  84.94 
 
 
239 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  84.12 
 
 
239 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  81.43 
 
 
240 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  81.86 
 
 
240 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  74.36 
 
 
241 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  71.49 
 
 
251 aa  361  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  71.91 
 
 
249 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  72.29 
 
 
251 aa  358  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  72.29 
 
 
251 aa  358  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  66.67 
 
 
240 aa  342  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  66.67 
 
 
242 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  66.11 
 
 
239 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  66.11 
 
 
242 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  67.23 
 
 
239 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  66.81 
 
 
235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  66.53 
 
 
242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  62.71 
 
 
240 aa  333  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  65.38 
 
 
242 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  65.4 
 
 
238 aa  332  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  65.25 
 
 
244 aa  331  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  65 
 
 
240 aa  331  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  64.58 
 
 
240 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  65.68 
 
 
239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  66.39 
 
 
238 aa  327  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  64.78 
 
 
237 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  65.94 
 
 
237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  68.4 
 
 
237 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  65.38 
 
 
237 aa  324  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  65.81 
 
 
241 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  64.1 
 
 
240 aa  324  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  65.81 
 
 
241 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  68.1 
 
 
237 aa  323  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  63.25 
 
 
240 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  67.97 
 
 
237 aa  323  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  63.25 
 
 
240 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  64.22 
 
 
235 aa  322  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  62.82 
 
 
242 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  65.68 
 
 
239 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  61.64 
 
 
234 aa  321  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  61.64 
 
 
234 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  64.1 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  63.09 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  64.94 
 
 
245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  63.83 
 
 
240 aa  318  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  64.44 
 
 
253 aa  319  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  63.95 
 
 
235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  63.91 
 
 
237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  62.71 
 
 
279 aa  318  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  64.66 
 
 
244 aa  317  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  64.71 
 
 
238 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  65.55 
 
 
238 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  61.21 
 
 
234 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  61.7 
 
 
239 aa  315  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  61.21 
 
 
235 aa  315  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  62.5 
 
 
241 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  60.78 
 
 
234 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  61.37 
 
 
235 aa  314  8e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  61.86 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  63.98 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  63.52 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  65.25 
 
 
238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  61.28 
 
 
241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  62.08 
 
 
241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  59.83 
 
 
255 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  59.58 
 
 
241 aa  310  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  62.07 
 
 
236 aa  310  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  62.87 
 
 
237 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  61.67 
 
 
241 aa  309  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  63.2 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  63.68 
 
 
244 aa  308  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  61.67 
 
 
241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  60.68 
 
 
236 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  61.8 
 
 
237 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  62.03 
 
 
242 aa  307  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  61.8 
 
 
237 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  61.18 
 
 
286 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  60.43 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  61.18 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  60.43 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  61.18 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  60 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  62.28 
 
 
261 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  61.02 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  61.86 
 
 
235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  61.8 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  61.8 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  61.18 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  61.18 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  61.18 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  61.8 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  61.8 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  61.18 
 
 
237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  59.48 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  61.37 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  61.37 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  62.13 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  63.75 
 
 
240 aa  305  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>