45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2650 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
182 aa  373  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  70.17 
 
 
182 aa  263  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  66.67 
 
 
188 aa  243  1e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  65.56 
 
 
183 aa  243  1e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  65 
 
 
188 aa  238  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  63.33 
 
 
187 aa  234  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55045e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  62.43 
 
 
185 aa  231  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.02 
 
 
202 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.72 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.03 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.9 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.52 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  32.04 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.65 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  31.64 
 
 
184 aa  81.3  7e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  28.57 
 
 
183 aa  80.5  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.04 
 
 
316 aa  78.2  6e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  28.65 
 
 
177 aa  77  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.2 
 
 
184 aa  75.9  3e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.04 
 
 
177 aa  74.3  8e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.91976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.35 
 
 
180 aa  71.6  5e-12  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.01 
 
 
179 aa  71.6  6e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
184 aa  68.9  4e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.2 
 
 
185 aa  65.9  3e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
182 aa  66.2  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  26.19 
 
 
180 aa  64.3  9e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  63.9  1e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.17 
 
 
176 aa  62  5e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  26.79 
 
 
180 aa  58.9  4e-08  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  28.57 
 
 
437 aa  56.2  2e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  6.3148e-08 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.93 
 
 
178 aa  55.1  6e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  53.9  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  30.46 
 
 
270 aa  50.1  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  29.33 
 
 
270 aa  48.9  4e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.79179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  25.77 
 
 
207 aa  47.8  9e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  24.53 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  28.4 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  30 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  25.53 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  29.29 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.85 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  25.53 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.47 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.41236e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.83 
 
 
194 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>