245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2640 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
454 aa  898    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  72.17 
 
 
452 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  54.29 
 
 
468 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  52.77 
 
 
453 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  49.67 
 
 
470 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  50.77 
 
 
459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  49.11 
 
 
446 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  46.68 
 
 
453 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  45.39 
 
 
450 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  46.76 
 
 
452 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  44.94 
 
 
450 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  50.11 
 
 
475 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  46.34 
 
 
464 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  44.3 
 
 
457 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  43.67 
 
 
486 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  44.06 
 
 
461 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  48.22 
 
 
486 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  47.5 
 
 
443 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  47.54 
 
 
464 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  46.53 
 
 
466 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  45.58 
 
 
452 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  48.57 
 
 
452 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  45.17 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  47.78 
 
 
453 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  44.12 
 
 
457 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  43.82 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  43.6 
 
 
453 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  47.29 
 
 
449 aa  352  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  44.12 
 
 
451 aa  349  5e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  42.53 
 
 
446 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  42.26 
 
 
453 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  43.25 
 
 
461 aa  342  8e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  42.31 
 
 
446 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  42.31 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  42.53 
 
 
446 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  42.53 
 
 
446 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  42.31 
 
 
446 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  46.48 
 
 
455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  42.31 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  42.08 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  42.53 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  45.59 
 
 
455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  41.24 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  41.86 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  41.86 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  41.18 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  44.98 
 
 
476 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  40.44 
 
 
455 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  42.67 
 
 
465 aa  329  6e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  44.73 
 
 
456 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  44.3 
 
 
468 aa  316  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  44.3 
 
 
486 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  43.38 
 
 
467 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  43.6 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  43.37 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  38.27 
 
 
446 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  38.27 
 
 
446 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  40.96 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  42.42 
 
 
460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  41.89 
 
 
452 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  41.89 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  39.66 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  41.83 
 
 
452 aa  306  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  41.61 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  41.61 
 
 
452 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  41.61 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  41.61 
 
 
452 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  39.51 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  41.31 
 
 
446 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  42.79 
 
 
452 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  45.85 
 
 
448 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  42.57 
 
 
452 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  41.63 
 
 
445 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  41.83 
 
 
452 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  41.29 
 
 
461 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  41.4 
 
 
445 aa  295  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  41.18 
 
 
445 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  41.18 
 
 
445 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34.08 
 
 
458 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  40.95 
 
 
445 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  40.72 
 
 
445 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  40.72 
 
 
445 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  41.18 
 
 
445 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  40.69 
 
 
470 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  40.72 
 
 
445 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  41.44 
 
 
447 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  37.61 
 
 
447 aa  292  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  41.7 
 
 
451 aa  291  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  39.29 
 
 
459 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  39.05 
 
 
478 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  37.89 
 
 
450 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  41.46 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  33.7 
 
 
454 aa  286  4e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  40.54 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  34.6 
 
 
457 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.55 
 
 
454 aa  283  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  34.55 
 
 
447 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  34.55 
 
 
447 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  36.9 
 
 
442 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  38.84 
 
 
452 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>