More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2610 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 147 aa  289  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  78.77 
 
 		 151 aa  233  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  75.51 
 
 		 148 aa  224  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  74.83 
 
 		 148 aa  223  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  73.47 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  72.79 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  74.15 
 
 		 147 aa  220  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  54.79 
 
 		 148 aa  160  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  48.61 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  48.61 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  49.66 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  45.14 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 168 aa  129  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  48.89 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  48.65 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 151 aa  121  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  46.15 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 189 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  44.03 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  44.03 
 
 		 189 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 209 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 194 aa  116  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 209 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  42.57 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  41.91 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  40.82 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 204 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 189 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 179 aa  113  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 189 aa  110  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  41.5 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 202 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  41.38 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 189 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0060  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.356425  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  39.31 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>