More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2608 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  85.88 
 
 		 94 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 92 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 92 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  84.81 
 
 		 91 aa  147  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  68.47 
 
 		 106 aa  147  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  76.74 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  75 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  71.21 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  51.82 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  67.61 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  65.15 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  65.15 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  65.15 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  52.58 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  61.43 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  69.84 
 
 		 74 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  65.15 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  44.95 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  68.33 
 
 		 76 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  64.52 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  61.19 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  62.32 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  58.67 
 
 		 87 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  59.46 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  58.21 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  65 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  60.87 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  47.31 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  54.55 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  51.19 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 78 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  60.66 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  61.67 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  51.19 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  61.67 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  50.59 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 75 aa  84.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 76 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  58.33 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>