159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2597 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  100 
 
 		 340 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  63.53 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  61.7 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  60.82 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  61.18 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  61.47 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  58.63 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  59.23 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  59.35 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  54.55 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  54.2 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  52.38 
 
 		 343 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  52.38 
 
 		 343 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  50.58 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  47.97 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  50.15 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  50.15 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  50.15 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  49.85 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  49.13 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  48.1 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  49.71 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  49.24 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  46.41 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  49.13 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  44.57 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  45.45 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  40.3 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.12 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.34 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.45 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.12 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.45 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.45 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.87 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  41.21 
 
 		 323 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  39.29 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  39.94 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  39.12 
 
 		 353 aa  238  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  38.71 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  37.72 
 
 		 346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  39.23 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  39.59 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  38.94 
 
 		 639 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  36.76 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  41.47 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  37.64 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  39.36 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  38.76 
 
 		 640 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.02 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  39.64 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  37.79 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  38.04 
 
 		 350 aa  225  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.69 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  38.12 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  39.37 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  35.17 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  38.15 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  37.06 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.36 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  38.1 
 
 		 624 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  35.47 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  38.3 
 
 		 631 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  36.13 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  36.8 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  36.1 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  36.07 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  32.46 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  32.85 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.69 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  31.48 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  33.92 
 
 		 346 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  30.92 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  29.97 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  33.92 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  29.69 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  33.9 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  31.69 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  29.83 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  31.46 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  31.4 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  30.97 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  34.22 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  29.53 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  29.17 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  29.83 
 
 		 368 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  29.41 
 
 		 368 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  29.78 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  32.16 
 
 		 387 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  28.61 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  31.38 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  30.81 
 
 		 393 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  29.89 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  29.3 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  29.3 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  29.78 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  33.63 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  29.58 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>