94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2570 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  430  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  73.96 
 
 
197 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  60.42 
 
 
328 aa  235  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  60.75 
 
 
324 aa  221  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  60.75 
 
 
324 aa  221  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  43.58 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  46.45 
 
 
337 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  45.3 
 
 
333 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  54.4 
 
 
342 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  44.13 
 
 
334 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  41.8 
 
 
326 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  41.8 
 
 
328 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  41.85 
 
 
192 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  88.75 
 
 
81 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  45.45 
 
 
332 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  43.33 
 
 
329 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  46.92 
 
 
141 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  37.19 
 
 
327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.55 
 
 
330 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  41.21 
 
 
330 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  49.22 
 
 
334 aa  134  9e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  40.11 
 
 
332 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  51.61 
 
 
356 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  49.21 
 
 
369 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  46.09 
 
 
291 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  44.53 
 
 
342 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  46.97 
 
 
353 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  45.53 
 
 
343 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  47.2 
 
 
350 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  43.51 
 
 
333 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  44.35 
 
 
345 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  46.34 
 
 
358 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  45.16 
 
 
342 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  42.75 
 
 
344 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  46.88 
 
 
340 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  46.03 
 
 
331 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  41.13 
 
 
354 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  41.48 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  41.13 
 
 
344 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  41.98 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  42.28 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  39.52 
 
 
344 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  43.2 
 
 
359 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  43.41 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  34.29 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  34.15 
 
 
365 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  39.37 
 
 
342 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  40.94 
 
 
340 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  37.1 
 
 
345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  37.1 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  36.49 
 
 
344 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  40.15 
 
 
339 aa  108  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  44.53 
 
 
336 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  46.9 
 
 
135 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  40.44 
 
 
352 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  42.74 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  39.52 
 
 
366 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  43.97 
 
 
342 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  40.32 
 
 
334 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  42.4 
 
 
338 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  44.35 
 
 
127 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  37.1 
 
 
344 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  30.77 
 
 
336 aa  101  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  41.74 
 
 
350 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  28.72 
 
 
334 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  34.33 
 
 
335 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  33.87 
 
 
341 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  37.12 
 
 
343 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  35.16 
 
 
333 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  29.94 
 
 
335 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  33.06 
 
 
341 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  33.91 
 
 
361 aa  95.5  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  41.23 
 
 
144 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  39.02 
 
 
356 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  29.66 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  37.62 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  31.03 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  31.03 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  29.75 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  45.78 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  26.45 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  26.45 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  27.27 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  47.17 
 
 
164 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  42.37 
 
 
81 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  30.77 
 
 
105 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  38.6 
 
 
88 aa  52  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  37.5 
 
 
55 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  29.89 
 
 
90 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  38.3 
 
 
77 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>