More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2537 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
412 aa  837    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  42.75 
 
 
1038 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.89 
 
 
760 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  44.42 
 
 
1450 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 
1827 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 
608 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.73 
 
 
688 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
523 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 
1212 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
740 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 
935 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 
578 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 
767 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.51 
 
 
689 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 
1005 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
955 aa  263  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.1 
 
 
1034 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.88 
 
 
574 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 
780 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  38.96 
 
 
577 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  38.44 
 
 
620 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 
3145 aa  255  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  39.02 
 
 
872 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 
601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 
620 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
615 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.96 
 
 
703 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  38.48 
 
 
747 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  38.52 
 
 
648 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 
542 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
747 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
662 aa  239  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  38.5 
 
 
626 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.89 
 
 
454 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 
639 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 
612 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  40.05 
 
 
636 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  38.05 
 
 
1077 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
505 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
636 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 
637 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
556 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 
529 aa  229  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
637 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
602 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
607 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
923 aa  225  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
614 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 
626 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 
614 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.84 
 
 
503 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  38.38 
 
 
626 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  38.38 
 
 
614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  38.38 
 
 
614 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
653 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  38.51 
 
 
653 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 
635 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 
611 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 
635 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.1 
 
 
1764 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
457 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  39.36 
 
 
1677 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 
681 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.41 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 
1451 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
1454 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
611 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
1073 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
438 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.23 
 
 
603 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  34.39 
 
 
615 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
545 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
646 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 
714 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  34.79 
 
 
705 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
649 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
649 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 
546 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.01 
 
 
540 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
536 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  36.01 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
588 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  37.13 
 
 
360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
714 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 
527 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.82 
 
 
546 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.8 
 
 
545 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 
646 aa  192  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 
593 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  32.09 
 
 
525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  35.86 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
545 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
451 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>