143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2498 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  47.44 
 
 
156 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  42.95 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  40.28 
 
 
156 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.95 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.67 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  42.41 
 
 
161 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.9 
 
 
162 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  38.81 
 
 
164 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.48 
 
 
156 aa  97.1  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.48 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  38.35 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  36.77 
 
 
157 aa  94.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  36.84 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.68 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
169 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.16 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.67 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  28.75 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  31.25 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  35.71 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  30.82 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  30.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  31.45 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  30.82 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  30.82 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  30.82 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  30.82 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  30.82 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  30.19 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.14 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  32.05 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  35.06 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  30.53 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  29.55 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  29.55 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  34.81 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.77 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.47 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.61 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.63 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.39 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  26.67 
 
 
181 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  28.39 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  31.33 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  27.45 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.15 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  34.81 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  31.91 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  33.74 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  25.95 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.67 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.93 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  33.58 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.93 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.67 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.59 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  30.43 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 
210 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  33.94 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
175 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.97 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.17 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  29.24 
 
 
190 aa  50.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  24.68 
 
 
196 aa  50.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.81 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.16 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.62 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.57 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  30.82 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.88 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  30.59 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  30.18 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  30.18 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  30.18 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  30.18 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  30.18 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  26.06 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.71 
 
 
187 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.39 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.17 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  29.93 
 
 
168 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.39 
 
 
161 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.08 
 
 
162 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  25.79 
 
 
155 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.84 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  31.65 
 
 
182 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  31.85 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  24.85 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  31.85 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  28.78 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  26.97 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  28.07 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.52 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  26.75 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  29.75 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>