More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2497 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
295 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  64.34 
 
 
295 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  60.07 
 
 
301 aa  328  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  59.79 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  62.2 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  64.06 
 
 
293 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  62.28 
 
 
293 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.8 
 
 
298 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.88 
 
 
366 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  55.51 
 
 
316 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.37 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  55.32 
 
 
382 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  55.32 
 
 
382 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.74 
 
 
290 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.56 
 
 
282 aa  219  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.85 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.63 
 
 
296 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.66 
 
 
296 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  42.63 
 
 
280 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 
297 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.4 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.75 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  37 
 
 
303 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  49.49 
 
 
297 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.08 
 
 
313 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.86 
 
 
348 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.2 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  51.69 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.34 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  50.85 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  47.92 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.25 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  50.56 
 
 
269 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.04 
 
 
274 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.18 
 
 
270 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.01 
 
 
335 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.17 
 
 
272 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.17 
 
 
272 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  44.29 
 
 
270 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  46.8 
 
 
270 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  50.54 
 
 
273 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.28 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.47 
 
 
383 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  52.69 
 
 
269 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  43.24 
 
 
273 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  52.69 
 
 
269 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.44 
 
 
656 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  41.9 
 
 
272 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  42.34 
 
 
273 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  48.7 
 
 
269 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.04 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.27 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
326 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  42.74 
 
 
340 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 
605 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 
605 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.94 
 
 
282 aa  152  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.14 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.94 
 
 
611 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.34 
 
 
598 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.34 
 
 
598 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.58 
 
 
313 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.9 
 
 
595 aa  151  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.77 
 
 
637 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.59 
 
 
587 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 
615 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.27 
 
 
617 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 
615 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 
615 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.07 
 
 
615 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.82 
 
 
617 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  47.34 
 
 
623 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.41 
 
 
605 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.4 
 
 
613 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.62 
 
 
614 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.14 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.55 
 
 
319 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.47 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.73 
 
 
614 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  33.33 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.18 
 
 
614 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.18 
 
 
614 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 
307 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.05 
 
 
613 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  35.59 
 
 
608 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  45.6 
 
 
394 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  43.75 
 
 
609 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.06 
 
 
311 aa  142  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  40.55 
 
 
612 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.2 
 
 
626 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0044  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.09 
 
 
316 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316268  normal  0.230689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  39.11 
 
 
583 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  35.71 
 
 
610 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.9 
 
 
614 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.2 
 
 
338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  35.58 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.93 
 
 
595 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.12 
 
 
613 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
287 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.33 
 
 
629 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>