More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2492 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  63.04 
 
 
639 aa  833    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  62.68 
 
 
647 aa  822    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  61.87 
 
 
645 aa  816    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  62.21 
 
 
643 aa  839    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  62.26 
 
 
636 aa  819    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
640 aa  1307    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  68.26 
 
 
642 aa  866    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  47.8 
 
 
619 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  41.79 
 
 
634 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  41.04 
 
 
646 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  39.71 
 
 
645 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 
609 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.4 
 
 
618 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  40.17 
 
 
597 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  39.93 
 
 
631 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  39.83 
 
 
630 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  38.58 
 
 
629 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  40.31 
 
 
646 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  39.11 
 
 
629 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 
636 aa  426  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 
629 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  38.35 
 
 
629 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  38.67 
 
 
646 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  38.2 
 
 
648 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  40.1 
 
 
646 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  41.01 
 
 
631 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 
648 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 
643 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  40.66 
 
 
631 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  37.3 
 
 
648 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  37.3 
 
 
648 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  36.77 
 
 
673 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 
624 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 
628 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  37.54 
 
 
633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  38.19 
 
 
630 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 
703 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 
681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  38.37 
 
 
611 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  38.62 
 
 
647 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  37.46 
 
 
630 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  36.47 
 
 
626 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  37.44 
 
 
631 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  37.89 
 
 
655 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  37.56 
 
 
631 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  37.07 
 
 
629 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 
630 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  38.76 
 
 
681 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 
633 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.56 
 
 
667 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  39.41 
 
 
630 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 
618 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  38.58 
 
 
647 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 
655 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  36.92 
 
 
637 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  36.87 
 
 
617 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  37.22 
 
 
617 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 
629 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 
664 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  36.02 
 
 
631 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  35.86 
 
 
631 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 
662 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  37.56 
 
 
684 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  35.86 
 
 
631 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
633 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 
618 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
633 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  36.24 
 
 
801 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  37.17 
 
 
803 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 
761 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  37.17 
 
 
803 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  38.11 
 
 
684 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  37.07 
 
 
802 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  37.94 
 
 
682 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  37.02 
 
 
619 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  36.25 
 
 
634 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
633 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  35.65 
 
 
755 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  37.17 
 
 
809 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  36.68 
 
 
634 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
633 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
618 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 
610 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 
633 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.7 
 
 
641 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
633 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.78 
 
 
801 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  36.12 
 
 
652 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 
618 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  37.17 
 
 
802 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 
678 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  36.62 
 
 
775 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 
649 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
633 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.07 
 
 
800 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 
618 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
633 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
633 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  37.17 
 
 
802 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 
650 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>