More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2491 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
366 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  77.05 
 
 
366 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  68.31 
 
 
366 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  65.85 
 
 
366 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  67.76 
 
 
366 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  66.12 
 
 
366 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  66.12 
 
 
366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  57.1 
 
 
365 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  47.83 
 
 
371 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  48.48 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  45.75 
 
 
373 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  45.75 
 
 
373 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  44.39 
 
 
369 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  41.32 
 
 
365 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  45.14 
 
 
371 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  45.48 
 
 
373 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  44.66 
 
 
373 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 
368 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  40.32 
 
 
378 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.16 
 
 
382 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 
373 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 
380 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  43.67 
 
 
371 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  44.03 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  42.62 
 
 
384 aa  265  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  46.29 
 
 
368 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  44.25 
 
 
368 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  41.9 
 
 
372 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  51.59 
 
 
371 aa  262  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  46.29 
 
 
368 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  45.17 
 
 
373 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  44.25 
 
 
376 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  43.08 
 
 
373 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  46.29 
 
 
368 aa  255  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  43.06 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  43.06 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  43.39 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  42.49 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  42.69 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  42.49 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  39 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  42.49 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  42.78 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  42.49 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  45.1 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  41.73 
 
 
378 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  42.94 
 
 
368 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  44.29 
 
 
366 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 
373 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  42.4 
 
 
376 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  45.45 
 
 
373 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 
377 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  43.85 
 
 
373 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.9 
 
 
387 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  44.55 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  44.55 
 
 
403 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  40.22 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  41.37 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  44.41 
 
 
370 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  42.55 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  37.91 
 
 
367 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  42.77 
 
 
370 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  42.26 
 
 
366 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  40.51 
 
 
366 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  42.08 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  41.99 
 
 
370 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  42.24 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  44.86 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  43.02 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  42.48 
 
 
370 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  44.84 
 
 
380 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 
385 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  42.53 
 
 
370 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  42.53 
 
 
370 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  42.45 
 
 
372 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  43.31 
 
 
368 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  42.45 
 
 
370 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  42.98 
 
 
373 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  42.82 
 
 
370 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 
382 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  39.83 
 
 
380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 
382 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 
382 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 
382 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 
382 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>