More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2459 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 344 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  53.56 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  53.7 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  49.03 
 
 		 358 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  48.26 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  46.91 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  43.43 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  46.25 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  45.02 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  39.75 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  39.87 
 
 		 620 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  40.92 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  39.48 
 
 		 440 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  40.96 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  38.38 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  40.07 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.94 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  40.39 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  36.51 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  37.29 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  35.18 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.85 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  37.2 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.75 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.73 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  39.2 
 
 		 389 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  40.46 
 
 		 343 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.86 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  37.3 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.41 
 
 		 377 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  36.66 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  37.42 
 
 		 337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  37.16 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  36.03 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  35.02 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  35.95 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.49 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  36.95 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  39 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.42 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  35.97 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  35.64 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  33.88 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  37.41 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  35.19 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  34.27 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  34.36 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  36.71 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>